原发性开角型青光眼（POAG）是全世界导致不可逆盲的主要原因。而目前全基因组相关联分析（GWAS）已经在欧洲和亚洲人种中确定了15个与POAG相关的基因位点，这些结果被青光眼相关的定量特征分析所支持，如眼压（IOP）和垂直C/D。相反，虽然对非洲人种进行了GWASs的研究，但迄今为止，还没有发现显著相关的位点。研究表明，与东亚（9.9%）和欧洲（7.4%）POAG的患病率相比，非洲（16.1%）POAG的患病率更高。因此本研究的目的是通过多中心的合作研究来解决POAG基因组的这一差异，从而探索非洲人种该疾病的发病机制。相关研究结果发表在JAMA杂志上。
本研究共分为两个组，分别是GWAS发现基因位点组和验证位点组。在发现基因位点组中，入组者来自加纳、尼日利亚、南非和杜克大学（北卡罗来纳州达勒姆），POAG的患者均存在青光眼性的视神经病变（C/D0.7或双眼间不对称0.2和/或视盘凹陷），视野缺损，房角开放以及无导致继发性青光眼视神经病变的疾病。眼压不作为纳入和排除患者的标准。正常对照为大于40岁且无青光眼症状和其他眼病的人，且符合眼压低于21mmHg，房角开放，视野正常及无青光眼家族史。所有纳入者均使用IlluminaOmniExpress芯片进行全基因组的基因分型，对整个人类基因组中超过70万个单核苷酸多态性（SNP）进行标记。
验证位点组也分为两个阶段，第一次利用既往POAG研究中的数据。第二次纳入来自马里、喀麦隆、尼日利亚(拉各斯、卡杜纳和埃努古)、巴西、沙特阿拉伯、刚果民主共和国、摩洛哥和秘鲁的患者和正常对照，通过SequenomMassArray系统和AppliedBiosystemsTaqman试验进行验证。对相关结果进行相关统计学分析。
研究最后共纳入个人参与本次的研究（表1）。基因位点组的荟萃分析发现在4号染色体的1个基因位点与疾病有显著的关联，其特征是多个SNP标记显示出高度的连锁不平衡（图1）。并将这关联定位到APBB2rsTC位点上（图2）。C等位基因被观察到与原发性开角型青光眼的风险增加有关（OR,1.32[95%CI,1.20-1.46];P=2×10?8）。
表1.纳入本项研究的对象
图1.个患者和个正常对照的分析
图2.4号染色体上的APBB2与疾病具有相关性
而验证位点组第一次验证发现APBB2rs上C等位基因与POAG风险增加有关(OR,1.13[95%CI,1.07-1.20];P0.;图3)。各个研究间没有明显的异质性（P=0.15）。而第二次验证也发现rs*C增加POAG的风险(OR,1.30[95%CI,1.12-1.51];P0.;图3)。10个地理区域间没有明显的异质性（P=0.27）。把两次验证组合并进行分析，结果一致，rs*C增加POAG的风险(OR,1.19[95%CI,1.14-1.25];P0.;图3)。但是rs*C与眼压和垂直C/D没有明显的相关性（P=0.62）。
图3.
APBB2rs与POAG的关系
综上所述，在这项GWAS研究中，发现APBB2上的变异与非洲人种原发性开角型青光眼相关。
参考文献：
GeneticsofGlau